陕西省眼科研究所是在省科技厅、省卫计委、西安市卫计委、西安市第一医院历届领导的关怀、支持和帮助下，在朱秀萍所长毕生执着追求及全体同仁艰苦奋斗下，在西安市眼科研究所、眼科医院的基础上，于2005年经原省卫生厅和省科技厅(2006年)、省编办正式批准成立的直属省科技厅管理的科研事业单位。
陕西省眼科研究所下设有陕西省眼科学重点实验室，医学转化部，陕西省眼科研究所青少年近视眼防治中心、陕西省眼科医师培训基地、西安市眼库，是我省唯一的“陕西省眼科疾病临床医学研究中心”。
学科带头人：朱秀萍，一级主任医师，教授，陕西省眼科研究所所长，陕西省眼科学重点实验室主任，西安市眼科院、陕西省眼科研究所创始人，国家级、省市级突出贡献专家，全国劳动模范，享受国务院政府特殊津贴，全国“三八”红旗手，近年获全国中华眼科学会奖、中华眼科学会西部创业奖，国家卫生部防盲指导组委员，中华全国眼库协会副会长，中华陕西眼科学会顾问，《国际眼科杂志》资深编委，《中华眼外伤职业眼病杂志》编委， 《加拿大国际眼科杂志》编委。历任全国角膜病学组委员20余年。
现研究所共有人员30余名，其中基础科研人员24人，含高级职称10人，博士、硕士10人，拥有眼科医师8人，获部、省、市科技进步奖20余项，尤其是近5年来，共获省市科技进步奖8项，国家发明专利4项，在研项目有：国家自然科学基金4项、省级科研项目19项。
作为我省唯一的眼科基础及临床科研机构，陕西省眼科研究所一直坚持践行“临床是科研的基础，科研是临床的升华”这一世界最先进的医学科研转化模式，以泪器病和干眼病为突破点，实现了科研成果的快速、成功转化，在眼科基础研究及临床科研成果转化方面，多项技术处国内领先及先进水平。
研究所主要研究、防控方向为：
1、泪器病专业
泪器病作为我所特色专业，诊疗技术国内先进、西北领先，目前主要开展泪道逆行置管术、泪道环形管植入术、泪道激光成形术、新生儿泪囊炎的治疗、泪道探通术、鼻腔内窥镜下泪囊造孔手术等，年手术量2000余例，其中引进并研究改良了的泪道逆行置管术已推广至省内20余家医院，获2012年陕西省科学技术三等奖。
2、干眼病专业
干眼病作为眼科常见多发病，一直是研究所科研及临床关注的重点。针对干眼病，我所创立了以杨华副所长为核心的干眼专科团队，先后建立了干眼病专家和专科门诊，创立和完善了西安地区干眼病诊断标准，健全和建立了10余项诊断和检查项目，开展多种治疗手段，进行了千余例的干眼流病调研，形成了具有特色的干眼病诊疗体系。目前我所干眼病的诊疗技术，已处于国内先进、省内领先行列。
近年来又先后获得干眼病各项基础和临床转化科研项目，如国家自然科学基金1项，省自然科学基金3项，西安市科研项目1项。近年来，累计门诊检测患者超过4万人次，门诊量14万人次以上。2015年成为国家卫计委领导下，北京同仁医院牵头的MGD诊疗全国多中心临床试验西北地区唯一的研究中心。
3、角膜眼表疾病临床及实验室快速诊断中心
眼病病原微生物复杂，病变取材难、量微小；病变急，致盲率高；早期诊疗极为重要。多年来，研究建立十余种特色的快速诊断及鉴别方法应用于临床，显著提高诊断水平。
4、眼用药物研究及转化开发
研究所眼用药物研究室针对眼科临床急需、市场空白，开展多项眼用新制剂研发工作。多年来，为临床研究开发20余种新制剂，均填补市场空白，解决临床急需，挽救了大量危重病人，实现了科研成果的转化，获得国家专利授权2项，获西安市科学技术三等奖一项。
5、异种人工生物角膜的研究及转化
积极进行异种人工生物角膜材料筛选研究。为解决临床角膜材料来源严重匮乏的问题，通过系列研究，筛选出非常接近人眼光学和组织结构的异种角膜，采用多种先进的脱细胞方法，制备出去细胞角膜基质载体，极大的降低材料的抗原性，减少术后排斥反应发生的风险。
该项目立为陕西省科技统筹重大攻关项目，并获得国家发明专利授权，目前已比照国家三类医疗器械的要求，制定出具有自主知识产权的十三项鸵鸟人工生物角膜质量标准，即将完成临床前研究，有望解决国内角膜材料来源极度匮乏的难题。
6、西安市眼库
角膜材料严重匮乏，角膜盲患者众多，已成为眼科难题。西安市眼库成立于1992年，国内最早的三大眼库之一，是中国眼库协会副会长单位，陕西省红十字角膜捐献西安工作站，并与北京成龙慈善基金会签约，加大眼库的社会影响力，推动自愿捐献角膜工作。多年来，眼库不断开拓角膜来源，与世界著名的美国eversight、sightlife眼库、斯里兰卡国际眼库结成合作伙伴，每年获得一定数量的角膜材料援助，缓解了临床角膜材料匮乏的困境，角膜移植手术量处国内先进行列，挽救了大量的角膜盲人使其重见光明，解放了劳动力，创造巨大的社会效益。
7、青少年近视眼防治中心
青少年近视眼不仅是医学问题，也是严重的社会问题。我省青少年近视防治形势严峻，发病率居高不下。2007年陕西省科技厅批准陕西省眼科研究所成立“陕西省青少年近视眼防治中心”，2008年，在省教育厅、科技厅、卫生厅的共同领导下，成立了“陕西省青少年近视防治领导小组”，办公室设在“防治中心”，使该“防治中心”成为陕西省近视眼防治的公益性服务平台。
防治中心坚持公益性、科学性，针对近视发病居高不下的严峻形势，在中小学做7万余人次的病因学调查研究，发现四项造成近视的主要原因，而且小学三年级是防控近视的关键时期。针对以上发现，研究所提出四项干预控制措施，已被教育厅和科技厅高度重视，且该项目被省科技厅立为2014年度科技攻关项目。
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